MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	GGA	2	6	22	27	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
2	NC_014157	CGC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137680
3	NC_014157	AGGG	2	8	63	70	25 %	0 %	75 %	0 %	296137680
4	NC_014157	TC	3	6	75	80	0 %	50 %	0 %	50 %	296137680
5	NC_014157	AAGG	2	8	145	152	50 %	0 %	50 %	0 %	296137680
6	NC_014157	AAAGC	2	10	155	164	60 %	0 %	20 %	20 %	296137680
7	NC_014157	CAGG	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	296137680
8	NC_014157	CTT	2	6	214	219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137680
9	NC_014157	GGA	2	6	250	255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
10	NC_014157	GAT	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137680
11	NC_014157	AAG	2	6	314	319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137680
12	NC_014157	GGA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
13	NC_014157	AGG	2	6	460	465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
14	NC_014157	GCT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137680
15	NC_014157	ACT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137680
16	NC_014157	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137680
17	NC_014157	TCT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137680
18	NC_014157	TCA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137680
19	NC_014157	CGA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137680
20	NC_014157	GAG	2	6	824	829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
21	NC_014157	GGA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
22	NC_014157	GAC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137680
23	NC_014157	AGG	2	6	966	971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137680
24	NC_014157	TGCCA	2	10	1005	1014	20 %	20 %	20 %	40 %	296137680
25	NC_014157	TGC	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137681
26	NC_014157	GTC	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137681
27	NC_014157	GTA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137681
28	NC_014157	CGG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137681
29	NC_014157	TTC	2	6	2949	2954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137681
30	NC_014157	TTC	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137681
31	NC_014157	TCG	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137681
32	NC_014157	TCC	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137681
33	NC_014157	TTC	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137681
34	NC_014157	CCT	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137682
35	NC_014157	TCC	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137682
36	NC_014157	GAT	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137682
37	NC_014157	TCC	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137682
38	NC_014157	CTC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137682
39	NC_014157	GAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137682
40	NC_014157	CGG	2	6	3464	3469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137682
41	NC_014157	CGT	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137682
42	NC_014157	ATC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137682
43	NC_014157	CAG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137682
44	NC_014157	AGG	2	6	3632	3637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137682
45	NC_014157	GCC	2	6	3705	3710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137682
46	NC_014157	GCC	2	6	3764	3769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137682
47	NC_014157	GGA	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137682
48	NC_014157	CCTG	2	8	4009	4016	0 %	25 %	25 %	50 %	296137683
49	NC_014157	TCC	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137683
50	NC_014157	CCG	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137683
51	NC_014157	GGC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137683
52	NC_014157	GGTTC	2	10	4220	4229	0 %	40 %	40 %	20 %	296137683
53	NC_014157	TGT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137683
54	NC_014157	ACG	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137683
55	NC_014157	CT	3	6	5518	5523	0 %	50 %	0 %	50 %	296137684
56	NC_014157	CCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137684
57	NC_014157	GCG	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137684
58	NC_014157	T	6	6	5705	5710	0 %	100 %	0 %	0 %	296137684
59	NC_014157	TCC	2	6	5751	5756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137684
60	NC_014157	TCC	3	9	5896	5904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137684
61	NC_014157	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137684
62	NC_014157	CCT	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137684
63	NC_014157	ACC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137684
64	NC_014157	AAAC	2	8	6047	6054	75 %	0 %	0 %	25 %	296137684
65	NC_014157	GAC	2	6	6314	6319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137685
66	NC_014157	GCT	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137685
67	NC_014157	TTG	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137685
68	NC_014157	GTC	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137685
69	NC_014157	TCC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137685
70	NC_014157	TCC	2	6	6699	6704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137685
71	NC_014157	GC	3	6	6825	6830	0 %	0 %	50 %	50 %	296137685
72	NC_014157	AGG	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137685
73	NC_014157	AAG	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137685
74	NC_014157	CTG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137685
75	NC_014157	ACT	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137685
76	NC_014157	GAA	2	6	6984	6989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137686
77	NC_014157	GCTG	2	8	7179	7186	0 %	25 %	50 %	25 %	296137686
78	NC_014157	TAG	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137687
79	NC_014157	AGC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137687
80	NC_014157	AAG	2	6	7435	7440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137687
81	NC_014157	ATC	2	6	7474	7479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137687
82	NC_014157	GAT	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137688
83	NC_014157	CTC	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137688
84	NC_014157	GAG	3	9	7744	7752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137688
85	NC_014157	AGA	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137688
86	NC_014157	A	6	6	7850	7855	100 %	0 %	0 %	0 %	296137688
87	NC_014157	T	6	6	8190	8195	0 %	100 %	0 %	0 %	296137689
88	NC_014157	CGTC	2	8	8225	8232	0 %	25 %	25 %	50 %	296137689
89	NC_014157	GAC	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137689
90	NC_014157	CCT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137690
91	NC_014157	TC	3	6	8830	8835	0 %	50 %	0 %	50 %	296137690
92	NC_014157	GGA	2	6	8843	8848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137690
93	NC_014157	CAC	2	6	8880	8885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137690
94	NC_014157	ACG	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137690
95	NC_014157	AAC	2	6	8967	8972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137690
96	NC_014157	TCG	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137690
97	NC_014157	TGCG	2	8	8988	8995	0 %	25 %	50 %	25 %	296137690
98	NC_014157	AGGC	2	8	9003	9010	25 %	0 %	50 %	25 %	296137690
99	NC_014157	TGC	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137690
100	NC_014157	CTC	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137690
101	NC_014157	GAA	2	6	9184	9189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137690
102	NC_014157	ATT	2	6	9212	9217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296137690
103	NC_014157	GGA	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137690
104	NC_014157	CGA	2	6	9313	9318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137690
105	NC_014157	CCCT	2	8	9324	9331	0 %	25 %	0 %	75 %	296137690
106	NC_014157	CT	3	6	9372	9377	0 %	50 %	0 %	50 %	296137690
107	NC_014157	TAC	2	6	9449	9454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137690
108	NC_014157	CTT	2	6	9589	9594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137691
109	NC_014157	CGG	2	6	9693	9698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137691
110	NC_014157	CCT	2	6	9720	9725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137691
111	NC_014157	CAA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137691
112	NC_014157	GCG	2	6	9761	9766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137691
113	NC_014157	CGA	2	6	9783	9788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137691
114	NC_014157	AGC	2	6	9806	9811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137691
115	NC_014157	AGG	2	6	9887	9892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137691
116	NC_014157	GT	3	6	9956	9961	0 %	50 %	50 %	0 %	296137691
117	NC_014157	GCC	2	6	10313	10318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
118	NC_014157	CTT	2	6	10342	10347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137692
119	NC_014157	TCC	3	9	10358	10366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137692
120	NC_014157	GAC	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137692
121	NC_014157	CCG	2	6	10484	10489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
122	NC_014157	G	6	6	10566	10571	0 %	0 %	100 %	0 %	296137692
123	NC_014157	CAT	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
124	NC_014157	CAG	2	6	10681	10686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137692
125	NC_014157	CTC	2	6	10720	10725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137692
126	NC_014157	CTG	2	6	10738	10743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137692
127	NC_014157	ATC	2	6	10753	10758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
128	NC_014157	GGC	2	6	10789	10794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137692
129	NC_014157	CCG	2	6	10830	10835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
130	NC_014157	GC	3	6	10857	10862	0 %	0 %	50 %	50 %	296137692
131	NC_014157	CAC	2	6	10902	10907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137692
132	NC_014157	CAT	2	6	10914	10919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
133	NC_014157	GCA	2	6	10923	10928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137692
134	NC_014157	TCG	2	6	10952	10957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137692
135	NC_014157	CGC	2	6	11037	11042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
136	NC_014157	GAG	2	6	11131	11136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137692
137	NC_014157	GCG	2	6	11154	11159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137692
138	NC_014157	ACT	2	6	11162	11167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
139	NC_014157	CTG	2	6	11176	11181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137692
140	NC_014157	CGGCCT	2	12	11199	11210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137692
141	NC_014157	GCG	3	9	11219	11227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137692
142	NC_014157	CTC	2	6	11256	11261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137692
143	NC_014157	CGC	2	6	11303	11308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
144	NC_014157	TAC	2	6	11401	11406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
145	NC_014157	C	6	6	11411	11416	0 %	0 %	0 %	100 %	296137692
146	NC_014157	GCGG	2	8	11439	11446	0 %	0 %	75 %	25 %	296137692
147	NC_014157	GGTGG	2	10	11449	11458	0 %	20 %	80 %	0 %	296137692
148	NC_014157	GCA	2	6	11516	11521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137692
149	NC_014157	GCC	2	6	11563	11568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137692
150	NC_014157	GAC	2	6	11590	11595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137692
151	NC_014157	GGC	2	6	11641	11646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137692
152	NC_014157	TAC	2	6	11662	11667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137692
153	NC_014157	TC	3	6	12518	12523	0 %	50 %	0 %	50 %	296137693
154	NC_014157	TGCCCT	2	12	12578	12589	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137693
155	NC_014157	AGC	2	6	12706	12711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137693
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159	NC_014157	ACA	2	6	12856	12861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137693
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162	NC_014157	GAAC	2	8	12950	12957	50 %	0 %	25 %	25 %	296137693
163	NC_014157	CA	3	6	12995	13000	50 %	0 %	0 %	50 %	296137693
164	NC_014157	GAA	2	6	13001	13006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137693
165	NC_014157	GGA	2	6	13011	13016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137693
166	NC_014157	AGTC	2	8	13111	13118	25 %	25 %	25 %	25 %	296137693
167	NC_014157	TGC	2	6	13130	13135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137693
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172	NC_014157	ACCGTC	2	12	13461	13472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137693
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246	NC_014157	CTTC	2	8	19502	19509	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
247	NC_014157	TCT	2	6	19577	19582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137697
248	NC_014157	TCCT	2	8	19686	19693	0 %	50 %	0 %	50 %	296137697
249	NC_014157	GGT	2	6	19713	19718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137697
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251	NC_014157	TCC	2	6	19819	19824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
252	NC_014157	TGG	2	6	19885	19890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137697
253	NC_014157	CAA	2	6	19895	19900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137697
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256	NC_014157	CTCC	2	8	19997	20004	0 %	25 %	0 %	75 %	296137697
257	NC_014157	AGG	2	6	20005	20010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137697
258	NC_014157	GGA	2	6	20036	20041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137697
259	NC_014157	CGC	2	6	20050	20055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137697
260	NC_014157	CCGG	2	8	20058	20065	0 %	0 %	50 %	50 %	296137697
261	NC_014157	CCT	2	6	20107	20112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
262	NC_014157	TCC	2	6	20128	20133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
263	NC_014157	GCG	2	6	20196	20201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137697
264	NC_014157	CCT	2	6	20210	20215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
265	NC_014157	CGC	2	6	20245	20250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137697
266	NC_014157	GGT	2	6	20282	20287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137697
267	NC_014157	TCT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137697
268	NC_014157	TCT	2	6	20383	20388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137697
269	NC_014157	GAC	2	6	20419	20424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137697
270	NC_014157	CCT	2	6	20546	20551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
271	NC_014157	CGT	2	6	20639	20644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137697
272	NC_014157	GTC	2	6	20691	20696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137697
273	NC_014157	ACC	2	6	20749	20754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137697
274	NC_014157	TCC	2	6	20764	20769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
275	NC_014157	CTG	2	6	20838	20843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137697
276	NC_014157	TCT	2	6	20854	20859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137697
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280	NC_014157	G	6	6	20980	20985	0 %	0 %	100 %	0 %	296137697
281	NC_014157	C	6	6	21000	21005	0 %	0 %	0 %	100 %	296137697
282	NC_014157	CTC	2	6	21051	21056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137697
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285	NC_014157	CGCCTC	2	12	21243	21254	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296137697
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295	NC_014157	GGC	2	6	21615	21620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137697
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342	NC_014157	GCCC	2	8	24687	24694	0 %	0 %	25 %	75 %	296137698
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371	NC_014157	GCGG	2	8	25851	25858	0 %	0 %	75 %	25 %	296137698
372	NC_014157	CCG	2	6	25889	25894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137698
373	NC_014157	GTG	2	6	25906	25911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137698
374	NC_014157	ACG	2	6	25970	25975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137698
375	NC_014157	GGAC	2	8	25991	25998	25 %	0 %	50 %	25 %	296137698
376	NC_014157	TGA	2	6	26022	26027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137698
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382	NC_014157	GAA	2	6	26377	26382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137698
383	NC_014157	GAA	2	6	26389	26394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137698
384	NC_014157	AGA	2	6	26435	26440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137698
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